Honda Vario 125 mengusung mesin 125 cc, 4-tak, SOHC dengan teknologi eSP (Enhanced Smart Power). Mesin ini mampu menghasilkan tenaga maksimal 11,1 PS pada 8.500 rpm dan torsi maksimal 10,8 Nm pada 5.000 rpm.
Sistem suplai bahan bakar menggunakan PGM-FI (Programmed Fuel Injection) yang meningkatkan efisiensi konsumsi bahan bakar hingga 51,7 km/liter metode WMTC (EURO 3, ISS ON).
Selain itu, Honda Vario 125 dilengkapi Honda Smart Key System untuk tipe ISS. Fitur lainnya adalah USB charger pada console box untuk charger type A dengan daya maksimum 5V, 2,1A.
Fitur Vario 125 lainnya adalah Smart Key System dengan alarm anti-theft dan answer back system (khusus varian CBS-ISS), Full Digital Panel Meter, Combi Brake System (CBS) untuk pengereman optimal, USB charger 5V 2.1A
Vario 160 CBS Active : Rp28.100.000
Vario 160 CBS Grande : Rp28.350.000