Pesawat ini memiliki perlindungan kokpit berlapis baja, kaca depan tahan peluru, serta sistem defensif aktif seperti flare dan chaff untuk menghindari ancaman rudal. A400M juga dilengkapi teknologi Directed Infrared Countermeasure (DIRCM) untuk pertahanan terhadap rudal berpemandu infra merah.
Selain sebagai pesawat angkut, A400M bisa berfungsi sebagai tanker udara dengan kapasitas bahan bakar hingga 51 ton—mampu melayani air-to-air refueling untuk banyak tipe pesawat tempur lain seperti F-18, Eurofighter, dan Hawk. Fitur airdrop hingga 25 ton dan kapasitas angkut maksimum sampai 37 ton memudahkan pengiriman personel atau logistik.
Struktur pesawat didominasi material komposit ringan yang kuat, termasuk sayap karbon-fiber. Sistem pendaratan utamanya memiliki 12 roda sehingga stabil saat beroperasi di berbagai jenis landasan.